FSCK un buen sistema para diagnosticar los errores del disco, en linux se puede ejecutar al inicio o al final, aunque este último tiene matices ya que lo que hace antes de apagar el sistema es reiniciarlo ejecutar FSCK y volverlo a apagar automáticamente, pero que ocurre si tenemos un disco grande, pues que se tira horas enteras buscando errores y no hay forma de interrumpirlo, pero no está todo perdido, hay una forma muy sencilla de saltar el proceso de FSCK y seguir trabajando, si bien yo no lo aconsejo pero cuando la necesidad aprieta se hace y punto, bueno la solución es la siguiente:

se introduce un cd linux live, de manera que cojas el control yo voy a poner de ejemplo guadalinex, se introduce el cd obtienes permisos de administrador, de la manera más fácil para alguien que empieza es ir a sistema/administración/usuarios y grupos, marcar root y dar a la opción propiedades, establecer una contraseña y abrir el explorador de archivos desde una terminal tecleando sudo nautilus y poniendo la contraseña antes introducida, también es factible con las teclas alt+f2, una vez hecho esto buscamos la carpeta /etc y el archivo fstab, lo abrimos y encontraremos algo parecido a esto:

# /etc/fstab: static file system information.
#
# Use 'vol_id --uuid' to print the universally unique identifier for a
# device; this may be used with UUID= as a more robust way to name devices
# that works even if disks are added and removed. See fstab(5).
#
#
proc /proc proc defaults 0 0
# / was on /dev/sda1 during installation
UUID=00ad6f74-07b1-499e-9122-72ce0d063c83 / ext3 relatime,errors=remount-ro 0 1
# swap was on /dev/sda5 during installation
UUID=23bcf69d-c1d2-4cae-a76b-c57126b4c87a none swap sw 0 0
/dev/scd0 /media/cdrom0 udf,iso9660 user,noauto,exec,utf8 0 0
/dev/fd0 /media/floppy0 auto rw,user,noauto,exec,utf8 0 0

donde vemos que en el disco ext3 hay al final de la línea un 1 que he puesto en negrita, pues este se pone a 0 y listo guardamos cambios y reiniciamos el pc y ya podemos trabajar, recomiendo encarecidamente volver a poner un 1 para que realice la comprobación cuando sea posible.

saludos y espero que te ayude.